Un pueblo pequeño y tranquilo, Gruta de Cristal (también conocido como Cueva Cristal), cuenta con una larga historia de avistamientos de fantasmas, duendes, posesión de demonios y otros sucesos paranormales. Este pueblo es el hogar del famoso grupo conocido como "Misterio a la Orden", compuesto por los adolescentes Fred Jones, Daphne Blake, Vilma Dinkley, Shaggy Rogers y por supuesto, el gran danés Scooby-Doo, donde ellos viven junto a sus familias. Siendo esta una secuela de la serie original, retrata a la pandilla como se los vió en ¿Scooby-Doo, Dónde estás?: los chicos son mejores amigos, asisten a la escuela secundaria, y durante el verano y las vacaciones, salen a viajar por todos lados en su camioneta, la Máquina del Misterio. Además, en su tiempo libre, van a la fuente de sodas a tomar helados, o a acompañar a su amiga Angel Dynamita mientras conduce su programa en la estación de radio K-Ghoul. A ellos les encanta resolver misterios, y la ciudad Gruta de Cristal es famosa por su historial de extrañas desapariciones y ataques de monstruos, por lo cual es una atracción para millones de turistas que la visitan, ansiosos de ser testigos de dichos eventos supernaturales.