El argumento de Atlantis sitúa a su protagonista, Jason (Jack Donnelly) navegando en busca de su padre, hasta varar en la orilla de una misteriosa isla que alberga un mundo de criaturas míticas, como diosas con cabello de serpientes, oráculos adivinos, palacios tan grandes que se dice que ?fueron construidos por gigantes?. Se trata de la ciudad de la Atlántida, donde acompañado de dos nuevos amigos, Pitágoras y Hércules hará frente al Minotauro y se batirá incluso con los muertos.